Cytoscape

Cytoscape 是开源免费的生物信息学与网络可视化分析软件，核心用于构建分子相互作用网络、蛋白互作网络、基因调控网络、代谢通路、社会关系网络，广泛应用于生物医药、分子生物学、医学科研、系统生物学领域。软件可导入基因、蛋白、药物靶点、代谢物等数据，构建节点 – 边形式的网络图谱，清晰呈现分子之间的相互作用关系；支持网络聚类、拓扑结构分析、富集分析，挖掘核心靶点、关键调控因子、核心通路，助力疾病机制、药物靶点、分子机理研究。可对网络节点进行颜色、大小、标签自定义美化，导出高清科研用图，直接用于 SCI 论文、医学课题、生物科研报告；兼容 STRING、TCGA、GEO 等生物数据库数据，一键导入分析，适配高通量测序数据挖掘。同时支持第三方插件拓展，增加 GO/KEGG 富集分析、生存分析、药物预测等功能，拓展科研深度。软件开源免费、跨平台运行，操作灵活，是国内外生物医药科研人员、高校生物医学专业学生必备的网络分析工具，有效助力分子机制、靶点筛选、疾病研究等科研项目开展。